《表1 本实验所用引物:利用mini-Tn10转座子文库筛选鳗弧菌M3表型发生变化的基因》
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《利用mini-Tn10转座子文库筛选鳗弧菌M3表型发生变化的基因》
根据Lee等(2008)的方法确定转座子插入突变子的数量,具体步骤:鳗弧菌M3 rpoB基因为单拷贝基因,选取其作为内参基因,neoR基因为转座子特有,选取其为目的基因,根据引物rpoB-for/rev、neo-for/rev(表1)扩增rpoB和neoR片段。连接rpoB片段和neoR片段,构建重组载体质粒,根据该质粒计算DNA拷贝数,并以该重组质粒为模板,rpoB-SYBR-for/rev、neoR-SYBR-for/rev为引物,制作标准曲线,得到扩增效率E值(ErpoB和EneoR),再以突变子DNA为模板,进行相对定量PCR,得到ΔCtrpoB和ΔCtneoR,由公式计算转座子插入个数。
图表编号 | XD00149200200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.01 |
作者 | 李倩、李贵阳、李杰、莫照兰 |
绘制单位 | 上海海洋大学水产与生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海水养殖病害防治重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海水养殖病害防治重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、上海海洋大学水产与生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海水养殖病害防治重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 |
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