《表1 本实验所用引物:利用mini-Tn10转座子文库筛选鳗弧菌M3表型发生变化的基因》

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《利用mini-Tn10转座子文库筛选鳗弧菌M3表型发生变化的基因》


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根据Lee等(2008)的方法确定转座子插入突变子的数量,具体步骤:鳗弧菌M3 rpoB基因为单拷贝基因,选取其作为内参基因,neoR基因为转座子特有,选取其为目的基因,根据引物rpoB-for/rev、neo-for/rev(表1)扩增rpoB和neoR片段。连接rpoB片段和neoR片段,构建重组载体质粒,根据该质粒计算DNA拷贝数,并以该重组质粒为模板,rpoB-SYBR-for/rev、neoR-SYBR-for/rev为引物,制作标准曲线,得到扩增效率E值(ErpoB和EneoR),再以突变子DNA为模板,进行相对定量PCR,得到ΔCtrpoB和ΔCtneoR,由公式计算转座子插入个数。