《表2 山荆子4个叶绿体基因间区的PCR扩增》

《表2 山荆子4个叶绿体基因间区的PCR扩增》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于叶绿体DNA变异的山荆子种质遗传多样性和系统演化》


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为保证双向测序能够测通叶绿体通用引物的扩增产物,从SHAW等[35]报道的叶绿体DNA序列中选取无回文结构的基因区间和扩增片段长度在1 500 bp以下的叶绿体通用引物,4个基因间区trn H-psb A、trn S-trn G spacer+intron、trn T-5'trn L和5'trn L-trn F对应的4对叶绿体通用引物(表1)由上海生工(Sangon)有限公司合成。50μL的PCR反应体系:DNA模板2μL,正向和反向引物(10μmol·L-1)各2.5μL,d NTP(2.5 mmol·L-1)(Ta Ka Ra,Japan)5μL,10×Buffer 5μL,Taq DNA聚合酶(5 U·μL-1)(Ta Ka Ra,Japan)0.6μL,ddH2O 32.4μL。参照VOLK等[36]报道的反应条件,对4个基因间区的PCR扩增条件进行优化(表2)。215份种质4个叶绿体间区的PCR产物用2%的琼脂糖凝胶电泳检测(图1),对于扩增成功并得到单一条带的样品直接送测序公司(上海美吉测序公司(北京))进行测序,测序仪为美国ABI 3730DNA Sequencer。每个样品在每个叶绿体DNA间区的扩增产物均进行正、反向测序,215份材料的4个间区的叶绿体DNA序列全部测通。