《表2 15种苹果属植物的4个cp DNA基因间区的多态性》

《表2 15种苹果属植物的4个cp DNA基因间区的多态性》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《苹果属15个种的叶绿体DNA变异与遗传分化》


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应用4对叶绿体通用引物对15种苹果属植物种质的4个cp DNA基因间区进行扩增,4个区域trn H-psb A、trn S-trn G spacer+intron、trn T-5’trn L和5’trn L-trn F在所有样本中的序列长度分别为343、1 457、1 336和984 bp。核苷酸多态性最高的区域为trn T-5’trn L,包含3个单一突变位点、20个简约信息位点和298个插入/缺失位点;核苷酸多态性最低的区域为5’trn L-trn F,仅有3个单一突变位点、2个简约信息性位点和8个插入/缺失位点。722份中国原产苹果属植物的4个cp DNA基因间区共有变异位点579个,其中区域trn T-5’trn L就有321个,是变异位点最多的区域。trn H-psb A的核苷酸多样性(Pi)最大,为0.034 09;5’trn L-trn F的核苷酸多样性(Pi)最小,为0.000 78。平均核苷酸差异(K)最大和最小的区域分别为trn T-5’trn L(K=21.726 73)和5’trn L-trn F(K=0.769 20)。trn H-psb A区域单倍型数目(h)最多,为48个,5’trn L-trn F区域单倍型数目(h)最少,为10个。trn H-psb A的单倍型(基因)多样性(Hd)最高,为0.808;5’trn L-trn F的单倍型(基因)多样性(Hd)最低,为0.577。722份苹果属植物种质的4个cp DNA区域合并后共有100个单倍型,核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异(K)和单倍型多样性(Hd)分别为0.009 52、39.021 33和0.879(表2)。