《表2 PCR反应程序:黄瓜幼苗下胚轴长度GWAS分析及候选基因挖掘》

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《黄瓜幼苗下胚轴长度GWAS分析及候选基因挖掘》


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为了验证候选基因的准确性,在黄瓜核心种质中选取4个长下胚轴材料(CG9、CG11、CG106、CG112)和4个短下胚轴材料(CG19、CG44、CG54、CG98),在播种后子叶展平、第一片真叶展平、一叶一心、第二片真叶展平、两叶一心5个时期采集下胚轴。使用日本TaKaRa公司的RNA提取试剂盒(9767)提取总DNA,用1%琼脂糖凝胶电泳检测提取得到的RNA质量。用TaKaRa公司的反转录试剂盒将提取到的RNA反转录成cDNA。用Nanodrop仪器检测c DNA的浓度及纯度,用ddH2O将cDNA稀释到50 ng?μL-1,用于荧光定量分析。根据预试验结果选择黄瓜Actin1作为内参基因;使用2-ΔΔCt计算基因的相对表达量。反应体系混合物的配置如表1,PCR反应程序如表2。