《表2 48对In Del标记信息》

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《鲜食番茄品种遗传多样性分析及指纹图谱构建》


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根据SGN数据库(http://solgenomics.net/)及前人研究结果,选取覆盖番茄Heinz 1706参考基因组的48个In Del(苏晓梅,2014)位点对75份鲜食番茄材料进行基因分型,引物详细信息见表2。使用MUSCLE软件(http://www.drive5.com/muscle/)将48个In Del标记序列信息比对到番茄Heinz 1706参考基因组获得标记所在区域信息,然后将75份番茄材料比对到该区域并检测该区域的变异信息。CC表示与参考基因组相比无变异,GG表示与参考基因组相比有变异(插入或者缺失),CG表示杂合位点,NN表示该位点分型结果缺失。