《表3 284对多态性In Del标记的引物信息》

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《基于重测序的芥蓝(Brassica alboglabra)全基因组InDel标记开发》


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利用Illumina Hi Seq TM系统对‘HJJL’和‘612F’进行10*深度的重测序,并以甘蓝基因组序列为参考基因组,找出样本之间的In Del位点,由北京诺禾致源科技有限公司完成测序和分析工作。挑选均匀分布于甘蓝9条染色体上的In Del位点,利用Primer3.0引物在线设计软件对In Del位点前后200 bp的序列设计引物。为了后续检测方便,In Del设计长度一般为100~300 bp,引物的Tm值为55℃~60℃。引物由上海生物工程有限公司合成。本研究开发的284对芥蓝多态性In Del标记的引物(表3)。