《表6 10折交叉验证的AUC值Tab.6 AUCs of the 10-fold cross validation》

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《基于碱基组成和分布的DNA序列特征提取方法及应用》

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基于24维特征向量，利用支持向量机（SVM）中的libsvm工具包来识别细菌的必需基因，具体操作如下:依次选择1株细菌作为训练集，剩余27株细菌作为测试集。利用网格搜索方法获取最优参数c和g。对于每一株细菌，采用10折交叉验证计算分类结果的AUC值（Area Under the receiver-operator-Curve，接受者操作特性曲线下面积），以此来衡量识别算法的性能。根据整体的分类效果，最终以Staphylococcus aureus N315作为训练集（所有的必需基因作为阳性训练集，所有的非必需基因作为阴性训练集），相应的最优参数c=819 2，g=0.007 812 5，得到较为理想的AUC值（见表6）。