《表2 乙醇沉淀法与滤膜抽滤法e DNA产量(均值±标准差)》

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《舟山近海水样环境DNA获取方法的建立》


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同体积水样使用乙醇沉淀法获得的eDNA产量高于滤膜抽滤法(表2、图1)。两种方法在15和120 mL实验组上均存在极显著差异(P<0.01)。120 mL乙醇沉淀法的eDNA产量与350 mL滤膜抽滤法的eDNA产量相当(F=0.33,P=0.60)。15和120 mL水样用乙醇沉淀法获得的eDNA产量是滤膜抽滤法的1.76—2.53倍。增大采样体积会显著提高eDNA产量。同一采样方法下15、120和350 mL任意两组间P<0.01。同时,检测结果的变异系数(Coefficient of variation,CV)(SD/AVE×100%)随采样量的增大而减小。这说明在采样量较低时,基于eDNA浓度对物种相对生物量的判定结果误差会较大。配套设备的限制,严重影响乙醇沉淀法的应用。目前很少有实验室配置4×400 mL以上规格的离心机。但滤膜抽滤法在45min则可采集350 mL以上的水样。滤膜抽滤法在水样抽滤体积上的优势,消除了其自身eDNA采集效率低于乙醇沉淀法的劣势。