《表4 GP基因的位点模型结果》

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《大弹涂鱼肝型GP基因的克隆及其在氨氮胁迫下的响应》

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-ln L：负自然对数；LRT：似然比检验；下同

利用大弹涂鱼等22种鱼类GP基因构建进化树，构建的GP基因贝叶斯树见图8。结果显示两种海鞘（玻璃海鞘(Ciona intestinalis），悉尼海鞘（Ascidia sydneiensis samea）)为外系群，大弹涂鱼与大鳍弹涂鱼（Periophthalmus magnuspinnatus）聚在一起，形成虾虎鱼目一支。大体上鲈形目、合鳃目、鲹形目、鳉形目、颚针鱼目、海龙鱼目、虾虎鱼目逐渐聚在一起形成一大支；鲤形目、裸背鱼目、脂鲤目、鲶形目聚在一起形成另一大支。在PAML中利用位点模型分析，结果表明鱼类GP基因在整体上处于纯化选择中，没有检测到正选择位点（表4）。此外，进化枝-位点模型在大弹涂鱼GP基因中检测到3个正选择位点（686G，715N，807G）（图7；表5）；而大鳍弹涂鱼和两种弹涂鱼祖先枝则均未检测出正选择位点（表5）。