《表1 菌株检测的标识序列引物》

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《一株蛴螬绿僵菌的分子鉴定》


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以绿僵菌Ma1518基因组DNA为模板,采用真菌通用引物ITS5/ITS4[14]PCR扩增菌株rDNA-ITS序列;采用Pbeta-F/Pbeta-R和PRPB2-F/PRPB2-R[15]引物分别扩增菌株β-tubulin和RPB2序列。引物序列见表1。rDNA-ITS序列、β-tubulin序列和RPB2序列的PCR反应体系都为:2×Taq Mix 10μL,模板DNA 1μL,上下游引物(10mmoL)各1μL,ddH2O 12μL,总共25μL。三个序列的PCR反应程序都为:94℃5 min;94℃30s,56℃30s;70℃30s,共30个循环;70℃延伸5min。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,回收纯化,送铂尚生物技术(上海)有限公司测序。分别将rDNA-ITS序列、β-tubulin序列和RPB2序列测序结果通过Blastn程序(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)与在GenBank中的基因序列进行同源性分析。下载常见近缘种的相应序列,以球孢白僵菌Beauveria bassiana相应序列作为外源种,分别用MEGA4.0软件ClustalX方法进行多序列比对,并以邻接法(neigbor-joining method)分别构建分子系统发育树,用Bootstrap对系统树进行检验,1000次重复[16]。