《表2 本研究SSR标记基因型分离比的卡方(χ2)检验》

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《图位克隆技术新型遗传学实验教学项目的设计与实践》


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df(自由度)=2,χ2>5.99时,P<0.05;χ2>9.21时,P<0.01。

计算结果显示,RM22426、RM22648和RM-22925与目标基因的重组率分别为47.5%、52.5%和60%,接近50%,且卡方检验其基因型分离比也符合1:2:1的遗传规律(P>0.05)(表2),表明这3个SSR标记与目标基因不连锁,发生了自由组合;而RM211-03、RM21309和RM21470与目标基因的重组率分别为0%、7.5%和22.5%,远小于50%,且卡方检验其基因型分离比也不符合1:2:1的遗传规律(P<0.01)(表2),表明这3个SSR标记与目标基因连锁,不能发生自由组合。将目标基因与连锁SSR标记的重组率转换成遗传距离后,发现RM21103与目标基因的遗传距离为0 cM,表明该SSR标记与目标基因非常近,为紧密连锁或共分离标记。而RM21309和RM21470的重组率分别为7.5和22.5 cM,与RM21103相比,这两个标记与目标基因距离较远,RM21470距离目标基因最远。基于上述分析可绘制出目标基因的染色体遗传连锁图(图3C)。