《表3 堆肥样品中真菌群落多样性指数》

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《添加剂对牛粪堆肥不同阶段真菌群落演替的影响》


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通过样品的Alpha多样性分析可以研究群落生态学的微生物多样性[36],常用的指标包括Coverage、ACE、Chao、Shannon以及Simpson指数.Coverage指数反映样品中基因序列被检测出来的覆盖率.由表3可知,堆肥阶段各个样品的Coverage指数都达到了0.99以上,表明测序结果可以很好地反映样品的真实情况[37].Chao和ACE指数常用来估算样本实际OTU数目从而反映真菌群落丰度.由表3的结果可知,随着发酵的进行,CK、B处理中高温阶段的ACE、Chao指数均明显低于初始混料,这可能是0~1d温度迅速上升使部分真菌不能适应剧烈环境温度的变化而死亡所致[38].V处理中真菌群落丰度在发酵各阶段均高于B处理和CK处理,可见V处理可以提高堆肥过程中真菌的群落丰度,而生物炭的添加仅降温阶段(相对于CK)提高了真菌群落丰度.Shannon、Simpson指数可以反映群落分布多样性,用于描述堆肥中物种分布规律[39].Shannon指数值越大,说明群落多样性越高,而Simpson指数值越大,群落多样性越低.3个处理都在高温阶段群落分布多样性最高,其中V和CK处理真菌丰度相差不大,Shannon指数的值分别为2.581和2.502,明显高于初始混料(1.560).然而,B处理Shannon指数的值在高温阶段为仅1.398,低于CK且呈下降的趋势,这与Du等[26]在研究生物炭对堆肥细菌群落多样性的影响中得出结果类似.在堆肥的降温阶段,B处理和V处理的Shannon指数值分别为1.319和1.296,高于空白处理(1.003),说明降温阶段的添加剂处理组真菌多样性较高,这与Simpson指数表现出的规律一致.