《表1 OTU划分和分类地位鉴定结果统计》

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《基于高通量测序的三七微生物群落结构特征分析》

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对原始序列进行筛选处理后，得到鲜三七有效序列40 912条，干三七有效序列55 446条，所得到的有效序列长度基本都在400 bp以上，说明目标序列的分离和扩增都比较稳定。使用QIIME(quantitative insights into microbial ecology）软件，调用UCLUST序列比对工具（Edgar，2010），对前述获得的序列按97%的序列相似度进行归并和OTU划分[19-20]。由表1可知鲜三七在各分类水平的OTU数均大于干三七，从Venn图（图1）中可以清楚地发现干三七和新鲜三七的共有OTU有15个，新鲜三七的菌群中独有的OTU为484个，是干三七OTU的3.93倍。鲜三七的多样性高于干三七，且鲜三七和干三七都具有自己独有的菌群。