《表2 多相分类鉴定结果统计》

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《细菌DNA特征序列鉴定法在常见种属中的鉴定水平研究》

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分别采用VITEK生化鉴定和Ribotyping核糖体分型鉴定方法，对收集的菌株进行多相分类鉴定，确认菌株遗传背景（如表2），结果显示：库克氏菌、微球菌、肠杆菌、肠球菌属中代表性菌株的多相分类鉴定结果一致；芽孢杆菌属中，枯草芽孢杆菌多相分类鉴定结果一致，苏云金芽孢杆菌、蜡样芽孢杆菌生化鉴定结果的分辨率低（low discrimination，指鉴定结果无确定的菌株名称），巨大芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌Ribotyping鉴定结果分辨率低（low probability，指仪器判读结果的菌株相似度<0.80或无确定的菌株名称）；柠檬酸杆菌属中，弗氏柠檬酸杆菌多相分类鉴定结果一致，杨氏柠檬酸杆菌、布氏柠檬酸杆菌Ribotyping鉴定结果的分辨率低，穆氏柠檬酸杆菌无法确认菌株遗传背景；假单胞菌属中，施氏假单胞菌、铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌多相分类鉴定结果一致，绿针假单胞菌、恶臭假单胞菌生化鉴定结果的分辨率低；不动杆菌属中，鲍曼不动杆菌、印度不动杆菌、拜氏不动杆菌生化鉴定结果的分辨率低，溶血不动杆菌Ribotyping鉴定结果的分辨率低；鞘氨醇单胞菌属中，少动鞘氨醇单胞菌Ribotyping鉴定结果的分辨率低，血红鞘氨醇单胞菌、玫瑰黄鞘氨醇单胞菌、维氏鞘氨醇单胞菌无法确认菌株遗传背景；罗尔斯通氏菌属中，皮氏罗尔斯通氏菌多相分类鉴定结果一致，茄科罗尔斯通氏菌生化鉴定结果的分辨率低。对于多相分类鉴定结果不一致或者无法确认菌株遗传背景的菌株，将测序获得的DNA特征序列与Genbank数据库进行比对，获取参比序列（Ref Seq），间接佐证菌株的遗传背景。