《表2 OTU划分和分类结果统计表》
将丰度值低于全体样本测序总量0.001%(十万分之一)的OTU(operational taxonomic unit)去除[16],并将去除了稀有OTU的此丰度矩阵用于后续的一系列分析。首先进行OTU划分并对分类地位鉴定结果进行统计,使用R软件将上述表中各样本在各分类水平的鉴定结果绘制成柱状图,可直观地比较不同样本的OTU数和分类地位鉴定结果的差异,如下图3、表2所示。B组猕猴桃门“Phylum”、纲“Class”、目“Order”、科“Family”、属“Genus”、种“Species”,OTU值均最高,平均总和达到了2000以上,说明B组猕猴桃真菌类微生物群落最为丰富,相对于其它4组均表现出极显著性差异(p<0.01)。A、C组猕猴桃真菌类微生物群落较为丰富,OTU值仅次于B组。D、E微生物群落则相对较为简单,尤其是E组,OTU值最低,平均总和仅在1000以内,相对于其它4组均表现出极显著性降低(p<0.01),说明E组微生物群落较为简单。实验与菌群落多样性指数的结果规律基本一致。
图表编号 | XD00192582900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.20 |
作者 | 石浩、王仁才、王芳芳、庞立、王琰、卜范文、周倩 |
绘制单位 | 湖南农业大学园艺园林学院、湖南应用技术学院农林科技学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学东方科技学院、湖南省园艺研究所、湖南农业大学园艺园林学院、湖南农业大学植物保护学院 |
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