《表5 12900-5特异突变位点示意表》

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《一株阴环炭团菌(香灰菌)转化子形态变异的成因》

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注：“+”表示SNP位点验证成功，“-”表示SNP位点验证为假阳性

采用GATK法分析基因组其他位点的差异，将12900-5菌株的SNP位点与对照菌株CK和12900-6菌株的SNP位点取交集，得到12900-5菌株特异的8个SNP位点（表5）。采用PCR法和Sanger测序法对12900-5特异SNP位点进行验证，以对照菌株CK为参照。其中突变位点Chr1 2091576与对照菌株CK相比是将T碱基置换成C碱基，这与该位点Sanger测序结果一致（图3B），其对应于阴环炭团菌TJAS01-V10005660基因，据Kiriyama et al.(2009）描述该基因与细胞分裂的S期有关。因菌丝营养生长主要依靠顶端的细胞分裂（窦洁和袁生1997），所以认为此碱基突变位点是引起变异的重要原因。突变位点Chr3 1732416与对照菌株CK相比是将C碱基置换成T碱基，这与该位点Sanger测序结果一致（图3B），且位于阴环炭团菌TJAS01-V10039540基因。研究发现TJAS01-V10039540基因与囊泡转运有关（Huang et al.2002），且泡囊中含有合成或降解细胞壁所需要的酶，如几丁质合成酶、纤维素合成酶（柏内特1989）等，从而影响新的细胞膜和细胞壁的合成。马聪（2007）认为囊泡转运是细胞生长繁殖的基本特征之一，所以同样认为该位点对细胞生长繁殖非常重要。其余6个特异SNP位点，经验证后为假阳性（表5）。