《表4 花期性状潜在候选基因》
基于该群体的LD衰减距离,在maizeGDB(https://www.maizegdb.org/)网站B73 AGPV2参考基因组图谱在显著位点上下游延伸120 kb范围内查找相关候选基因,共发现81个有基因描述的候选基因(以GeneID划分,未列出),将GeneID列表上传到GO网站进行二级分类,仅有36个得到分类,涉及4个花期性状DTT、DTA、DTS、ASI的数量为5个、6个、12个、16个。可归类到9个生物过程(36个),4类分子功能(21个),4类细胞组成(16个),其中在生物过程部分候选基因多集中于细胞组织化或生物再生(11个)和代谢活动(11个),在分子功能部分中多集中于结合(6个)和催化活性(6个),在细胞组成中多集中于细胞区域(11个)(图4)。综合数据得到与DTA、ASI有关的4个潜在候选基因(表4),其中GRMZM5G877-647编码early flowering 4(ELF4)蛋白,参与光周期、昼夜节律的调节;GRMZM2G173630编码类GID1蛋白参与植物激素信号转导;GRMZM2G001139、GRMZM2G375707编码与花器官建成的MADS-box转录因子。
图表编号 | XD00117214700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.14 |
作者 | 李真、刘文童、杨硕、郭晋杰、赵永锋、黄亚群、陈景堂、祝丽英 |
绘制单位 | 河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室、河北农业大学农学院国 |
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