《表4 花期性状潜在候选基因》

《表4 花期性状潜在候选基因》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《玉米花期性状的全基因组关联分析》


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基于该群体的LD衰减距离,在maizeGDB(https://www.maizegdb.org/)网站B73 AGPV2参考基因组图谱在显著位点上下游延伸120 kb范围内查找相关候选基因,共发现81个有基因描述的候选基因(以GeneID划分,未列出),将GeneID列表上传到GO网站进行二级分类,仅有36个得到分类,涉及4个花期性状DTT、DTA、DTS、ASI的数量为5个、6个、12个、16个。可归类到9个生物过程(36个),4类分子功能(21个),4类细胞组成(16个),其中在生物过程部分候选基因多集中于细胞组织化或生物再生(11个)和代谢活动(11个),在分子功能部分中多集中于结合(6个)和催化活性(6个),在细胞组成中多集中于细胞区域(11个)(图4)。综合数据得到与DTA、ASI有关的4个潜在候选基因(表4),其中GRMZM5G877-647编码early flowering 4(ELF4)蛋白,参与光周期、昼夜节律的调节;GRMZM2G173630编码类GID1蛋白参与植物激素信号转导;GRMZM2G001139、GRMZM2G375707编码与花器官建成的MADS-box转录因子。