《表5 五个主要开花期QTL的候选基因分析》

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《油菜开花期QTL定位和候选基因分析》


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注:序列差异指候选基因序列在两亲本中双11和No.73290中的SNP和Indel差异,没有标出的表示没有找到差异。

从已发表的文章和作物网站中收集到442个控制植物开花期的基因,用它们的序列和油菜基因序列进行Blast分析,找到它们在油菜参考基因组中的同源基因1197个。其中,本研究定位到的14个QTL的物理区间内共有54个同源基因,可能是这些开花期QTL的候选基因(表4)。特别是在3年中都能检测到的5个QTL(qDtF.A2-1、qDtF.A6-2、qDtF.C2-1、qDtF.C2-2、qDtF.C3-1)中,分别筛选到8、5、4、2、4个,并且有15个在亲本中存在序列差异,可以用来进行后续研究(表4和表5)。而在qDtF.C6-1物理区间内没有找到开花期同源基因,说明它很可能是由新的开花期基因控制。