《表4 百粒重性状相关大效应QTL和候选基因》

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《东北大豆种质群体百粒重QTL-等位变异的全基因组解析》

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61个主效显著位点中仅有39个位点上或其扩展区域中存在共计739个基因，其中602个基因中没有SNP或者没有检测到与SNPLDB显著连锁的SNP，另外137个基因中包含了248个与SNPLDB显著关联的SNP。GO分析显示这137个基因中的83个涉及多种生物过程，包括初级新陈代谢、翻译、蛋白修饰、物质运输、胁迫响应、信号转导，对刺激的响应、器官发育、细胞生长以及一些未知过程（图1-f）。例如，候选基因Glyma18g52250内包含了8个SNP，组成了7种单倍型，对应着位点q-SW-18-7中的5种等位变异。由于候选基因Glyma18g52250前3个SNP并不在位点q-SW-18-7的区间内，因此，候选基因的单倍型数目比位点的等位变异数目多。另外，12个大效应QTL筛选到的候选基因主要参与大豆的代谢、转录、翻译、对刺激响应以及一些未知的生物过程，6个大效应QTL位点没有筛选到候选基因（表4）。