《表5 百粒重QTL-等位变异在熟期组间的变化》

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《东北大豆种质群体百粒重QTL-等位变异的全基因组解析》


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表格的上半部分:a1—a8表示每个QTL等位变异的编号,由a1至a8效应依次增大。表格中白色单元格表示负效应等位变异,灰色单元格表示正效应等位变异,没有大写字母的单元格表示MGI+Ⅱ的所有等位变异。带有小写字母“x”“y”“z”的单元格分别表示MG0、MG00、MG000 3个熟期组中汰

将大豆品种按照生育期进行熟期组划分,有助于品种交流、引种以及育种方案的设计。根据盖钧镒等[33]提出的中国大豆熟期组划分方法,将本研究群体材料划分为000、00、0、Ⅰ和Ⅱ等5个熟期组。其中,Ⅰ和Ⅱ为东北大豆种质旧熟期组,000、00和0为东北大豆种质新熟期组。不同熟期组的百粒重均值变幅为19.7—20.4 g,虽然平均数差异不大,但百粒重最小值为9.9—18.8 g,最大值为21.8—25.6 g,各熟期组之间百粒重变幅差异较大(表1)。基于百粒重QTL-等位变异体系分析,东北大豆熟期缩短过程中百粒重位点等位变异发生了一定的新生和汰除(表5)。这里将旧熟期组Ⅰ和Ⅱ合并(MGI+Ⅱ)作为基础,将新熟期组遗传结构与之比较,结果显示,从MGI+Ⅱ到MG0,MG0中同时新生了一些大效应的正效应和负效应等位变异,例如在QTL q-SW-20-1上新生了第1、2、7和8号等位变异,QTL q-SW-14-2的上新生了第1号等位变异。q-SW-20-1的第8号和QTL q-SW-14-2的第1号等位变异分别是本研究中百粒重QTL-等位变异体系中正负效应的最大值。由MG0到MG00,MG0中新生的QTL q-SW-20-1的第8号等位变异以及其他33个小到中等正效应的等位变异在MG00中被汰除,但MG00中汰除的负效应大部分为小效应等位变异。由MG00到MG000,MG000汰除了一批效应较大的负效和正效等位变异,其中就包括最大负效应等位变异(q-SW-14-2的第1号等位变异,效应值为-7.39)以及较大正效等位变异(q-SW-20-1的第7号等位变异,效应值为4.74)。而新增的等位变异中最大正、负效应分别仅为1.20和-3.78,这就使得MG000中材料的百粒重变幅在2个方向均大幅缩小,即从9.9—24.8到18.8—21.8。