《表3 PfPDF1,PfPDF2的结构域预测》

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《紫苏防御素基因的克隆与分析》

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植物防御素由信号肽和成熟肽两部分组成，SignalP 4.1在线工具预测PfPDF1、PfPDF2均具有信号肽。由于植物防御素真正发挥功能的是成熟肽，因此我们分析了在去除信号肽序列后的PfPDF1、PfPDF2成熟肽序列的基本特征（表2）。PfPDF1、PfPDF2的成熟肽是由48个氨基酸残基组成，呈碱性，具有5个净正电荷的疏水蛋白。SMART在线工具对PfPDF1、PfPDF2的保守结构域预测显示（表3），它们都具有一个Knot1保守结构域，但PfPDF1具有一个跨膜域而PfPDF2不具有，这和TMHMM Server v.2.0预测的结果一致。