《表3 葱蝇防御素基因家族成员基本理化特征Tab.3 Basic physicochemical characteristics of members of defensin gene family

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《葱蝇防御素基因的鉴定及针刺对基因表达的影响》

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通过BLASTP（https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）比对以及Pfam（http://pfam.xfam.org/）和SMART（http://smart.embl-heidelberg.de/）的结构域分析，本研究共获得了3个防御素同源基因DaDef1，DaDef2和DaDef3且均含有完整的开放阅读框，它们所编码的防御素前体的氨基酸残基数目分别为91，94和91个；3个成熟肽DaDef1，DaDef2和DaDef3均由40个氨基酸残基组成，理论分子量分别为4.09，4.12和4.09kDa，理论等电点分别为8.71，8.69和8.35（表3）。通过序列比对发现，葱蝇与其他昆虫防御素的氨基酸序列有很高的一致性，如成熟肽Dadef1与新陆原伏蝇（Protophormia terraenovae）防御素的一致性达98%。亚细胞定位预测分析显示3个防御素成熟肽均为外分泌型。Signal P分析显示葱蝇防御素前体均含有23个氨基酸残基组成的信号肽序列，也说明葱蝇防御素是一种外分泌型抗菌肽，在合成后通过信号肽的引导分泌到细胞外行使功能。多肽的亲/疏水性分析发现3个成熟肽均为亲水性多肽，只是亲水系数略有差异，分别为73.25，73.25和83；但均属于稳定多肽。