《表4 S基因推导氨基酸突变与CV777比对分析结果》
注:“·”表示与CV777株氨基酸相同,“-”表示氨基酸缺失。
本试验扩增的S基因部分片段位于S1区,含有PEDV的中和抗原表位[12-13],S基因核苷酸同源性比对发现,不同病料样品的S基因与不同的参考株的同源性有差别。对S基因进行遗传进化分析可知,S基因在地域上有差异,不同地域的样品属于不同的基因群和基因亚群,并与不同的代表毒株在一个分支。本试验将河南地区的8株PEDV的S基因和疫苗毒株CV777的S基因的氨基酸位点进行比对发现:所有毒株均有不同程度的氨基酸位点的突变,从表4中可知,181212-1有5个突变,与CV777最相似,181753-1有9个突变,180276-3、180276-6和180435-1均有10个突变,181737-1和181737-2均有32个突变,均有2个缺失和3个插入,180278-1有34个突变,有2个缺失和3个插入。这些氨基酸位点的突变可能会影响S抗原位点产生中和抗体的能力,从而改变流行毒株的抗原性。这对做好PEDV的防控、选择合适的PEDV疫苗株提供了理论参考。
图表编号 | XD00109111600 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.10.10 |
作者 | 李凡、赵坤坤、刘守川 |
绘制单位 | 洛阳中科基因检测诊断中心有限公司、洛阳中科基因检测诊断中心有限公司、洛阳中科基因检测诊断中心有限公司 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |