《表2 筛选得到的基因及其功能描述》
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《玉米茎叶夹角相关基因ZmCLA2-2启动子结合蛋白的筛选》
测序结果通过NCBI Blast找到其翻译的氨基酸序列和与其高度同源的CDS序列,将二者进行比对,筛选比对结果一致的即为候选阳性转化子。从中筛选到33个互作蛋白(表2),其中有逆境相关的蛋白如zinc finger A20 and AN1、转移酶、水解酶和激酶等酶类,细胞色素p450 superfamily、光反应系统相关基因、叶绿素结合蛋白,类黄酮类蛋白,家族蛋白类等一系列的蛋白和转录因子。结合ZmCAL2-2基因的功能基因,对互作基因在功能注释网站(http://ensembl.gramene.org)进行功能注释。注释结果表明GRMZM2G086277是锌指C2H2-型家族蛋白,在根、茎、叶和幼穗中呈组成性表达。锌指蛋白是转录因子的一种,对真核生物的生长发育及逆境胁迫的耐受能力都有着重要影响;GRMZM2G089528属于黄酮类参与次级代谢产物的代谢和激素的生物合成、GR-MZM5G836222 zinc finger A20 and AN1主要与植物的逆境相关;GRMZM5G866947是属于泛素结合酶家族参与多种代谢。因此,将这些基因作为进一步的研究对象做回转验证。
图表编号 | XD00103602000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.14 |
作者 | 柳华峰、豆丹丹、李天移、刘志学、赵倩男、朱芳芳、任真真、苏慧慧、库丽霞、陈彦惠 |
绘制单位 | 河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院、河南农业大学农学院 |
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