《表2 10个关键基因(degree≥14)的功能描述及其与患者预后的关系》

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《基于GEO乙型肝炎病毒相关肝癌芯片数据的生物信息学分析》


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注:*高表达组与低表达组的风险比(hazard ratio)。

基于在线分析网站STRING评估蛋白质相互作用,再运用Cytoscape cytoHubba插件的Degree算法筛选出PPI网络互作程度最高的前10个关键基因。见图2。在GEPIA数据库中使用Kaplan-Meier法分析关键基因与预后的关系。细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子3(CDKN3)与HCC预后无关;细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)、上皮细胞转化序列2(ECT2)、DNA拓扑异构酶ⅡA(TOP2A)、透明质酸介导的运动受体(HMMR)、E3泛素连接酶(DTL)、丝/苏氨酸激酶NIMA相关激酶(NEK2)、纺锤体检测点蛋白(BUB1B)和雌激素受体1(ESR1)的总体生存率在高表达组和低表达组之间比较差异有统计学意义,除ESR1高表达组优于低表达组外,其余均劣于低表达组。见表2。