《表3 数据集1探针编号及序列》
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《长江中游常见鱼类DNA条形码研究及其电子芯片分析》
注:加粗为无效探针
初步筛选出46个物种的130条探针,OligoCalc优化后去除12条不合格探针,获得43个物种的118条探针(表3)。所得探针与对应物种序列在OHM中虚拟杂交,结果显示:有些探针特异性不强,与靶标序列结合的同时还能与其他物种的序列结合,其中TZ83为花的探针,不仅与唇的序列杂交,还与泉水鱼的序列杂交,相同的情况有TZ3-4、TZ8-9、TZ12、TZ14、TZ17、TZ19、TZ21、TZ35-36、TZ39、TZ67-68、TZ71-75、TZ83-89、TZ93-99、TZ109、TZ114和TZ117。厚颌鲂(M.Pellegrini)和贝氏?(H.bleekeri)仅筛选出了1个探针TZ37、TZ60,但不能与其靶标序列结合。最后有32个物种的80条探针能与靶标序列杂交,而不与非靶标序列杂交,可作为物种的鉴别探针。
图表编号 | XD00102142700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.01 |
作者 | 郜星晨、姜伟、刘绍平 |
绘制单位 | 中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室、中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所三峡工程鱼类资源保护湖北省重点实验室、农业农村部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站中国水产科学研究院长江水产研究所 |
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