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第一章数据整理与准备1

第一节数据的类型1

一、名称数据1

二、顺序属性数据2

三、数量属性数据3

第二节数据预处理3

一、数据简缩4

二、数据转换4

三、数据标准化6

第三节预处理的MATLAB实现14

一、MakeExcelFileName函数14

二、MakeExcelColumnName函数15

三、OutputExcel函数16

四、DataTransform函数17

五、StandardizeData函数19

第二章多样性指数计算25

第一节物种多样性指数25

一、α多样性指数25

二、α多样性计算的MATLAB实现31

三、β多样性指数37

第二节系统发育多样性40

一、群落系统发育α多样性指数40

二、群落系统发育β多样性指数42

第三节功能多样性44

一、功能α多样性指数45

二、功能β多样性指数47

第三章种间关系分析49

第一节种间关联49

一、总体关联性分析49

二、种对间关联性分析51

三、种间关联计算的MATLAB实现54

第二节种间相关61

一、Pearson相关系数61

二、Spearman相关系数63

第三节种间分离65

一、Pielou分离指数66

二、Pielou分离指数的MATLAB实现68

第四节种间竞争71

一、竞争强度71

二、竞争指数的MATLAB实现72

第四章生态位74

第一节生态位测度计算75

一、生态位宽度计算75

二、生态位重叠指数77

三、生态位分离85

四、多物种生态位重叠指数85

五、生态位重叠的应用85

第二节生态位计算的MATLAB实现86

一、niche函数86

二、WangOverlap函数90

三、nobp函数92

第五章空间格局分析93

第一节种群分布类型及其判定93

一、植物分布类型与模型描述93

二、分布格局类型的验证94

第二节单种群格局规模分析103

一、等级方差分析法104

二、双项轨迹方差法108

三、随机配对法112

第三节单种群格局纹理分析118

一、斑块-间隙分析法118

第四节大尺度格局分析123

一、趋势面分析123

二、典范趋势面分析131

第六章排序147

第一节极点排序法148

一、步骤148

二、实例计算149

三、极点排序法的MATLAB实现151

第二节主成分分析法155

一、主成分分析概述155

二、主成分分析排序步骤156

三、实例计算157

四、主成分分析的MATLAB实现160

第三节典范主成分分析法164

一、原理与步骤164

二、实例计算165

三、典范主成分排序的MATLAB实现168

第四节主坐标分析法171

一、原理与步骤171

二、实例计算173

三、主坐标分析的MATLAB实现174

第五节对应分析法178

一、原理与步骤178

二、实例计算179

三、对应分析排序的MATLAB实现181

第六节修订型对应分析法186

一、原理与步骤186

二、实例计算187

三、修订型CA/RA排序的MATLAB实现190

第七节除趋势对应分析法193

一、原理与步骤193

二、实例计算194

三、除趋势对应分析的MATLAB实现196

第八节典范对应分析法200

一、原理与步骤200

二、实例计算202

三、典范对应分析的MATLAB实现206

第九节除趋势典范对应分析法213

一、原理与步骤213

二、实例计算213

三、除趋势典范对应分析的MATLAB实现216

第七章群落数量分类222

第一节相似的表达方法222

一、仅适用于二元数据的相似关系223

二、适用于二元数据和数量数据的相似关系230

第二节等级聚类法235

一、等级聚类方法的步骤235

二、几种常用的聚合策略238

三、等级聚类分析的MATLAB实现240

第三节关联分析法243

一、原理与步骤243

二、实例计算244

三、关联分析法的MATLAB实现248

第四节双向指示种分析法254

一、原理与步骤254

二、实例计算255

三、双向指示种分析法的MATLAB实现260

主要参考文献272