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导言1

细菌在生物世界中的位置1

鉴定机制4

十九部分检索表7

原核生物界8

门Ⅰ 蓝细菌8

门Ⅱ 细菌9

第一部分 光能自养菌10

目Ⅰ 红螺菌目10

科Ⅰ 红螺菌科12

属Ⅰ 红螺菌属12

属Ⅱ 红假单胞菌属13

属Ⅲ 红微菌属14

科Ⅱ 着色菌科14

属Ⅰ 着色菌属16

属Ⅱ 囊硫菌属17

属Ⅲ 八叠硫菌属18

属Ⅳ 硫螺旋菌属18

属Ⅴ 荚硫菌属18

属Ⅵ 闪囊菌属19

属Ⅶ 网硫菌属19

属Ⅷ 板硫菌属20

属Ⅸ 可变杆菌属20

属Ⅹ 外硫红螺菌属21

科Ⅲ 绿菌科21

属Ⅰ 绿菌属22

属Ⅱ 突柄绿菌属23

属Ⅲ 绿假单胞菌属23

属Ⅳ 暗网菌属24

属Ⅴ 格状绿菌属24

第二部分 滑动细菌25

目Ⅰ 粘细菌目25

科Ⅰ 粘球菌科27

属Ⅰ 粘球菌属27

科Ⅱ 原囊菌科28

属Ⅰ 原囊菌属28

科Ⅲ 孢囊杆菌科29

属Ⅰ 孢囊杆菌属29

属Ⅱ 蜂窝囊菌属30

属Ⅲ 标桩菌属30

科Ⅳ 多囊菌科30

属Ⅰ 多囊菌属31

属Ⅱ 小（侏）囊菌属32

属Ⅲ 软骨霉状菌属32

目Ⅱ 噬纤维菌目33

科Ⅰ 噬纤维菌科33

属Ⅰ 噬纤维菌属34

属Ⅱ 屈挠杆菌属35

属Ⅲ 滑柱菌属36

属Ⅳ 柔发菌属36

属Ⅴ 腐败菌属37

属Ⅵ 生孢噬纤维菌属37

科Ⅱ 贝日阿托氏菌科38

属Ⅰ 贝日阿托氏菌属38

属Ⅱ 透明颤菌属38

属Ⅲ 辫硫菌属39

科Ⅲ 西蒙斯氏菌科39

属Ⅰ 西蒙斯氏菌属40

属Ⅱ 小链菌属40

科Ⅳ 亮发菌科40

属Ⅰ 亮发菌属41

属Ⅱ 发硫菌属41

亲缘关系未定科和属41

曲发菌属41

无色菌科42

无色菌属42

泥线菌科42

泥线菌属43

无色线菌属43

泥辫菌属44

花丛菌属45

第三部分 鞘细菌46

球衣菌属46

纤发菌属47

软发菌属48

利斯克氏菌属49

栅状发菌属49

泉发菌属49

细枝发菌属50

第四部分 生芽的和（或）有附属物的细菌51

生丝微菌属52

生丝单孢菌属52

土微菌属54

柄杆菌属54

不粘柄菌属56

臂微菌属57

突柄微菌属57

枝硫菌属58

巴斯德氏柄菌属58

芽生杆菌属59

塞里伯氏菌属59

嘉利翁氏菌属59

涅瓦河菌属60

浮霉状菌属60

生金菌属61

柄球菌属62

库兹涅佐夫氏菌属62

第五部分 螺旋体菌63

目Ⅰ 螺旋体目63

科Ⅰ 螺旋体科63

属Ⅰ 螺旋体属64

属Ⅱ 脊螺旋体属65

属Ⅲ 密螺旋体属65

属Ⅳ 疏螺旋体属67

属Ⅴ 钓端螺旋体属68

第六部分 螺旋状和弯曲的杆菌70

科Ⅰ 螺菌科70

属Ⅰ 螺菌属70

属Ⅱ 弯曲杆菌属75

亲缘关系未定属76

蛭弧菌属76

微环菌属76

暗屈曲菌属77

短弓菌属77

第七部分 革兰氏阴性好氧杆菌和球菌78

科Ⅰ 假单孢菌科78

属Ⅰ 假单胞菌属79

属Ⅱ 黄单胞菌属84

属Ⅲ 动胶菌属85

属Ⅳ 葡萄杆菌属86

科Ⅱ 固氮菌科87

属Ⅰ 固氮菌属88

属Ⅱ 氮单孢菌属89

属Ⅲ 拜叶林克氏菌属90

属Ⅳ 德克斯氏菌属92

科Ⅲ 根瘤菌科92

属Ⅰ 根瘤菌属93

属Ⅱ 土壤杆菌属94

科Ⅳ 甲基单孢菌科96

属Ⅰ 甲基单孢菌属96

属Ⅱ 甲基球菌属96

科Ⅴ 盐杆菌科97

属Ⅰ 盐杆菌属97

属Ⅱ 盐球菌属99

亲缘关系未定属99

产碱菌属99

醋杆菌属100

布鲁氏菌属101

博德特氏菌属102

弗朗西斯氏菌属104

栖热菌属104

第八部分 革兰氏阴性兼性厌氧杆菌105

科Ⅰ 肠杆菌科105

族Ⅰ 埃希氏菌族106

属Ⅰ 埃希氏菌属106

属Ⅱ 爱德华氏菌属106

属Ⅲ 柠檬酸细菌属107

属Ⅳ 沙门氏菌属109

属Ⅴ 志贺氏菌属110

族Ⅱ 克雷伯氏菌族110

属Ⅵ 克雷伯氏菌属111

属Ⅶ 肠杆菌属111

属Ⅷ 哈夫尼菌属112

属Ⅸ 沙雷氏菌属112

族Ⅲ 变形菌族113

属Ⅹ 变形菌属113

族Ⅳ 耶尔森氏菌族115

属Ⅺ 耶尔森氏菌属115

族Ⅴ 欧文氏菌族116

属Ⅻ 欧文氏菌属116

科Ⅱ 弧菌科121

属Ⅰ 弧菌属122

属Ⅱ 气单胞菌属124

属Ⅲ 邻单胞菌属126

属Ⅳ 发光杆菌属126

属Ⅴ 射光杆菌属128

亲缘关系未定属128

发酵单胞菌属128

色杆菌属129

黄杆菌属130

嗜血菌属132

阴道嗜血菌133

巴斯德氏菌属134

放线杆菌属135

心杆菌属136

链杆菌属137

鞘杆菌属138

野口氏菌属138

第九部分 革兰氏阴性厌氧细菌142

科Ⅰ 拟杆菌科142

属Ⅰ 拟杆菌属150

属Ⅱ 梭杆菌属155

属Ⅲ 纤毛菌属155

亲缘关系未定属156

脱硫弧菌属156

丁酸弧菌属157

琥珀酸弧菌属157

琥珀酸单孢菌属157

毛螺菌属157

月形单胞菌属158

第十部分 革兰氏阴性球菌和球杆菌159

科Ⅰ 奈瑟氏球菌科159

属Ⅰ 奈瑟氏球菌属160

属Ⅱ 布兰汉氏球菌属161

属Ⅲ 莫拉氏菌属162

属Ⅳ 不动杆菌属162

亲缘关系未定属163

副球菌属163

俊片菌属163

第十一部分 革兰氏阴性厌氧球菌165

科Ⅰ 韦荣氏球菌科165

属Ⅰ 韦荣氏球菌属165

属Ⅱ 氨基酸球菌属166

属Ⅲ 巨型球菌属167

第十二部分 革兰氏阴性化能无机营养细菌168

a．氧化氨或硝酸盐的细菌168

科Ⅰ 硝化杆菌科168

属Ⅰ 硝化杆菌属169

属Ⅱ 硝化刺菌属169

属Ⅲ 硝化球菌属169

属Ⅳ 亚硝化单胞菌属170

属Ⅴ 亚硝化螺菌属170

属Ⅵ 亚硝化球菌属170

属Ⅶ 亚硝化叶菌属171

b．代谢硫的细菌171

属Ⅰ 硫杆菌属172

属Ⅱ 硫化叶菌属174

属Ⅲ 硫小杆菌属174

属Ⅳ 大单胞菌属174

属Ⅴ 卵硫菌属174

属Ⅵ 硫螺菌属175

c．沉淀铁或镁氧化物的细菌科Ⅰ 鞘铁菌科175

属Ⅰ 鞘铁菌属176

属Ⅱ 淄曼氏菌属176

属Ⅲ 赭菌属177

属Ⅳ 铁球菌属177

第十三部分 产甲烷细菌178

科Ⅰ 甲烷杆菌科178

属Ⅰ 甲烷杆菌属178

属Ⅱ 甲烷八叠球菌属179

属Ⅲ 甲烷球菌属179

第十四部分 革兰氏阳性球菌180

a．好氧和（或）兼性厌氧菌180

科Ⅰ 微球菌科180

属Ⅰ 微球菌属181

属Ⅱ 葡萄球菌属182

属Ⅲ 动性球菌属184

科Ⅱ 链球菌科184

属Ⅰ 链球菌属185

属Ⅱ 明串珠菌属190

属Ⅲ 片球菌属192

属Ⅳ 气球菌属193

属Ⅴ 孪生球菌属193

b．厌氧球菌194

科皿 消化球菌科194

属Ⅰ 消化球菌属194

属Ⅱ 消化链球菌属196

属Ⅲ 瘤胃球菌属197

属Ⅳ 八叠球菌属198

第十五部分 芽孢杆菌和球菌199

科Ⅰ 芽孢杆菌科199

属Ⅰ 芽孢杆菌属199

属Ⅱ 芽孢乳杆菌属206

属Ⅲ 梭菌属206

属Ⅳ 脱硫肠状菌属215

属Ⅴ 芽孢八叠球菌属215

亲缘关系未定属颤螺菌属217

第十六部分 革兰氏阳性无芽孢杆状细菌217

科Ⅰ 乳杆菌科217

属Ⅰ 乳杆菌属217

亲缘关系未定属222

利斯特氏菌属222

丹毒丝菌属223

显核菌属224

第十七部分 放线菌及其相关的细菌类群225

杆状菌群225

属Ⅰ 杆状菌属229

a．人和动物的寄生菌和病原菌229

b．植物致病性棒杆菌230

c．非致病性棒杆菌231

属Ⅱ 节杆菌属231

亲缘关系未定属234

短杆菌属234

微杆菌属234

属Ⅲ 纤维单孢菌属235

属Ⅳ 库特氏菌属236

科Ⅰ 丙酸杆菌科236

属Ⅰ 丙酸杆菌属237

属Ⅱ 真杆菌属237

目Ⅰ 放线菌目248

科Ⅰ 放线菌科251

属Ⅰ 放线菌属251

属Ⅱ 蛛网菌属255

属Ⅲ 双歧杆菌属256

属Ⅳ 丝杆菌属257

属Ⅴ 罗氏菌属257

科Ⅱ 分枝杆菌科258

属Ⅰ 分枝杆菌属258

科Ⅲ 弗兰克氏菌科266

属Ⅰ 弗兰克氏菌属266

科Ⅳ 游动放线菌科269

属Ⅰ 游动放线菌属271

属Ⅱ 螺孢菌属272

属Ⅲ 链孢囊菌属272

属Ⅳ 无定形孢囊菌属273

属Ⅴ 小瓶菌属274

属Ⅵ 水生角质菌属274

属Ⅶ 游动单孢菌属275

属Ⅷ 游动双孢菌属275

属Ⅸ 指孢囊菌属275

属Ⅹ 北里菌属276

科Ⅴ 嗜皮菌科277

属Ⅰ 嗜皮菌属278

属Ⅱ 地嗜皮菌属278

科Ⅵ 诺卡氏菌科279

属Ⅰ 诺卡氏菌属279

属Ⅱ 假诺卡氏菌属282

科Ⅶ 链霉菌科283

属Ⅰ 链霉菌属283

属Ⅱ 链轮丝菌属308

属Ⅲ 鱼孢菌属314

属Ⅳ 小荚孢囊菌属314

科Ⅷ 小单孢菌科315

属Ⅰ 小单孢菌属316

属Ⅱ 高温放线菌属318

属Ⅲ 两歧放线菌属318

属Ⅳ 高温单孢菌属319

属Ⅴ 小双孢菌属319

属Ⅵ 小多孢菌属320

第十八部分 立克次氏体322

目Ⅰ 立克次氏体目322

科Ⅰ 立克次氏体科323

族Ⅰ 立克次氏体族323

属Ⅰ 立克次氏体属323

属Ⅱ 罗卡利马氏体菌属325

属Ⅲ 考克斯氏体属325

族Ⅱ 埃里希氏体族325

属Ⅳ 埃里希体属326

属Ⅴ 考德里氏体属326

属Ⅵ 新立克次氏体属327

族Ⅲ 沃尔巴克氏体族327

属Ⅶ 沃尔巴克氏体属327

属Ⅷ 共生小体属328

属Ⅸ 蟑螂杆状体属328

属Ⅹ 立克次氏小体属329

科Ⅱ 巴尔通氏体科329

属Ⅰ 巴尔通氏体属329

属Ⅱ 格拉汉氏体属330

科Ⅲ 无形体科330

属Ⅰ 无形体属331

属Ⅱ 类无形体属332

属Ⅲ 埃及小体属332

属Ⅳ 血巴尔通氏体属333

属Ⅴ 血虫体属333

目Ⅱ 衣原体目334

科Ⅰ 衣原体科334

属Ⅰ 衣原体属334

第十九部分 枝原体337

纲Ⅰ 柔膜体纲337

目Ⅰ 枝原体目337

科Ⅰ 枝原体科338

属Ⅰ 枝原体属338

科Ⅱ 无胆甾原体科341

属Ⅰ 无胆甾原体属341

亲缘关系未定属341

热原体属341

螺原体属342

附录344

术语汇编344