《表2 三种HDAC抑制剂调控基因的差异性表达》
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《钙离子通道亚基Cacnb3对小鼠脂肪间充质干细胞成骨分化的促进作用》
相对于对照,所有基因的FDR值为0.05(95%置信度).
已有文献报道组蛋白去乙酰化酶抑制剂具有促进成骨分化的功能,经DECenter软件分析,从数据集GSE9247中得到591个受HDACi调控的差异表达基因。用R软件分析,从数据集GSE79815中获得353个在成骨诱导中高表达、在成脂诱导中低表达的基因。将以上两个数据集分析得到的基因做合集分析,得到共同差异表达上调基因22个(表2),这些基因均受MS-275、VPA和TSA这3种HDAC抑制剂调控,并且在成骨中高表达,在成脂中低表达。这22个基因中有6个基因与Ca2+调节相关,包括Cacnb3、Lpcat2、CD248、Nid2、Notch3和Thbd,其中Qpct基因与锌离子调节功能相关。
图表编号 | XD0096090100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.01 |
作者 | 伏玺、王峰 |
绘制单位 | 天津医科大学基础医学院遗传学系、天津医科大学基础医学院遗传学系 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |