《表4 差异表达基因:葡萄籽原花青素对结肠癌细胞抑制作用的初步研究》
为探究GSPs对SW480和SW620调控的机制,利用Illumina HiSeq测序平台对SW480和SW620细胞转录组进行测序分析,结果显示,SW480细胞系中差异表达基因共8 094个,SW620细胞系中差异表达基因共9 200个(图5)。经过GO功能和KEGG pathway的生物信息学分析,其中涉及到差异基因数量较多的几个信号通路分别是代谢途径、PI3K/Akt、癌症途径、HTLV-I感染、癌症中的转录失调信号通路(表2和表3),Akt在细胞存活和凋亡中起重要作用,同时我们发现有超过200个差异基因涉及到Akt通路,SW480细胞中差异基因286个,与Akt通路相关的差异基因占3.85%(表2),SW620细胞中差异基因302个,与Akt通路相关的差异基因占3.58%(表3)。因此,我们从细胞凋亡相关的差异基因里选出了部分基因做进一步的验证(表4)。
图表编号 | XD0096090500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.01 |
作者 | 石焕焕、吕程程、朱运峰 |
绘制单位 | 北京交通大学生命科学与生物工程研究院、北京交通大学生命科学与生物工程研究院、北京交通大学生命科学与生物工程研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |