《表1 近几年湖泊沉积物中古DNA研究》
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《现代分子生物技术在湖泊沉积物古DNA研究中的应用》
相比于有孔虫、孢粉、脂类大分子化合物等,DNA更不稳定,其在环境中因受到氧化和水解作用等破坏会发生不同程度的降解,使得古DNA总是以高度片段化的小分子量的形式存在于样品中(H9ss et al.,1996;Mitchell et al.,2005)。古DNA的保存状况与样品的年代无直接联系,而是埋藏环境如温度、p H值、腐植酸含量、离子强度等会直接影响其降解速率(盛桂莲等,2016)。Torti等(2015)指出,矿物和有机大分子对DNA有很强的吸附性,可以保护DNA并使其降解程度降低。沉积环境条件如低温、缺氧、高盐度、粘土矿物含量丰富等,可能会有利于DNA的保存(Hofreiter et al.,2001;Willerslev et al.,2005;Toritet et al.,2015),湖泊沉积环境往往具有上述特点。Coolen等(2004b)从古老的湖泊沉积物中提取出全新世末(距今约9.4 ka)的藻类古DNA,并成功地扩增了硅藻18S r DNA序列片段。Pedersen等(2013)从湖泊沉积物中提取出全新世末(距今约10 ka)的植物古DNA,并扩增和测序了植物光合作用基因rbcl片段。近年来,众多研究表明,湖泊沉积物等样品中包含已保存数千年甚至长达数百万年以来的古DNA(表1)。
图表编号 | XD0094219900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 严东娜、徐海、侯卫国 |
绘制单位 | 中国科学院地球环境研究所黄土与第四纪地质国家重点实验室、中国科学院大学、天津大学表层地球系统科学研究院、西安交通大学人居环境与建筑工程学院、中国地质大学(北京)生物地质与环境地质国家重点实验室 |
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