《表1 实验元数据和示例:小鼠肝脏蛋白质组数据门户》

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《小鼠肝脏蛋白质组数据门户》


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门户网站共包含834组关于小鼠肝脏的蛋白质组实验数据,其中60组为2010–2017年间已发表的小鼠肝脏的蛋白质组数据集,从文献中筛选实验数据的标准是:研究对象是小鼠肝脏的蛋白质组;蛋白质组分析技术是基于质谱仪器;定量方法采用非标定量[16]技术。774组实验数据来自笔者的科研团队。这些实验包含464组蛋白全谱[17](Profiling)和310组转录因子DNA结合活性谱[18](catTFRE),catTFRE技术是利用转录因子可与序列特异性DNA元件结合的特点,合成了100种转录因子结合序列的串联多拷贝双链DNA结合元件,将其用生物素标记以包装成DNA诱饵富集细胞中内源性转录因子,将被DNA诱饵捕获的内源性转录因子利用串联质谱技术进行定性和定量。定量方法同样是非标定量。实验的基本信息按照表1中提供的字段进行整理。