《表3 层孔虫与相关生物之间的主要异同点(据Galloway,1957;Stearn,1972,1975;Wu,1991;董得源,2001)》

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《层孔虫研究进展与展望》

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层孔虫的起源和亲缘关系长期悬而未决主要有2个原因:（1）层孔虫与多种不同的生物都有着相似性（表3），这样的相似性体现在不同的方面，如层孔虫共骨的层状生长方式与四射珊瑚具有相似性，其组织结构的剥落情况与古杯动物（Archaeocyatha）相似（Galloway，1957）；（2）化石记录表明层孔虫于早白垩世末灭绝，所以仅根据硬体的特征来恢复和重建其软体组织比较困难（董得源，2001）。目前还未发现能与层孔虫的硬体骨骼作可靠对照的现生生物，也就是说只能通过一些间接的方法去获悉层孔虫的本质生物学属性。