《表6 正交实验直观分析结果》

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《云南金花茶SSR-PCR反应体系的建立与优化》

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根据正交实验L16 (45）进行PCR反应，其结果如图3所示，不同用量的Mg2+、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物和模板DNA组成的体系都会导致PCR扩增效果出现明显差异。在16个处理中，处理13扩增条带较弱，其他各处理均扩增出不同亮度的条带，处理8、10、12、16效果较好，条带清晰，明亮，无明显弥散现象。对SSR-PCR正交实验16个处理进行打分，分别为：3、3、5、9、3、7、11、16、3、13、10、14、1、12、4、16；3、4、8、9、3、7、10、16、3、13、11、14、1、12、5、15。由表6可知，各因素的主次顺序为：RB>RA>RD>RC>RE，即5个因素对云南金花茶SSR-PCR反应体系的影响由大到小依次为：Mg2+、引物、Taq DNA聚合酶、dNTP、模板DNA。A因素4个水平对云南金花茶SSR-PCR反应体系的影响主次顺序为：A3>A2>A4>A1，即引物用量在0.6μL时扩增效果最好；B因素4个水平对云南金花茶SSR-PCR反应体系的影响主次顺序为：B4>B2>B3>B1，即Mg2+用量在1.5μL时扩增效果最好；C因素4个水平云南金花茶SSR-PCR反应体系的影响主次顺序为：C3>C1>C4>C2，即d NTP量在0.3μL时扩增效果最好；D因素4个水平对云南金花茶SSR-PCR反应体系的影响主次顺序为：D1>D3>D2>D4，即Taq DNA聚合酶用量在0.1μL时扩增效果最好；E因素4个水平对云南金花茶SSR-PCR反应体系的影响主次顺序为：E1>E4>E2>E3，即DNA用量在0.5μL时扩增效果最好。kB4值最大为13.625，所以该值对应的反应体系最好，该值对应的体系为处理4、8、12、16组成的体系。