《表3 VQ基因之间的共线性关系》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《双子叶植物VQ基因家族的全基因组鉴定与盐胁迫下的表达模式分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

基因芯片和转录组测序（RNA-seq）技术是检测基因表达水平的重要手段。本研究通过查询NCBI GEO数据库，获取拟南芥GSE16765，葡萄GSE31594中盐胁迫相关的基因芯片数据，以及Sergel A等公布的不同时空和逆境胁迫下81个转录组数据，并筛选出3个物种中VQ基因在Na Cl处理下的表达水平（图5）。结果显示，拟南芥中25个（80%）VQ基因在叶片中检测到表达值，其中At VQ13、At VQ20、At VQ21、At VQ9、At VQ6、At VQ11、At VQ3、At VQ29、At VQ12、At VQ18和At VQ19该11个VQ基因对100 mmol·L-1的Na Cl处理有较高的敏感性（图5A）。GSE31594基因芯片以未处理、120 mmol·L-1 Na Cl分别处理1、4、8和24 h的葡萄为实验组，筛选VQ基因的表达水平。如图5B所示，葡萄中仅5个基因与探针匹配，其中Vv VQ16、Vv VQ17、Vv VQ5和Vv VQ6在盐胁迫下高表达；并且Vv VQ5在未处理和盐胁迫对照组实验中表现出差异表达的趋势。根据杨树VQ基因表达水平的结果，将51个基因聚类为3类:cluster I、cluster II和cluster III（图5C）。Cluster I中有8个基因，基因表达水平较高；cluster II有25个基因，表达水平偏低，尤其是Pt VQ49、Pt VQ36、Pt VQ2和Pt VQ15 4个基因表达水平为0；cluster III中有18个基因，表达水平位于cluster I与cluster II中的基因之间。Pt VQ47、Pt VQ20、Pt VQ9、Pt VQ50、Pt VQ34、Pt VQ1、Pt VQ11、Pt VQ40、Pt VQ13、Pt VQ23、Pt VQ51、Pt VQ4和Pt VQ19对盐胁迫有响应，其中Pt VQ13在用100mmol·L-1 Na Cl处理叶片7 d后，基因表达水平显著提高。为进一步验证VQ基因响应盐胁迫表达水平，本研究随机选择了杨树中Pt VQ1、Pt VQ18和Pt VQ31进行荧光定量PCR检测。结果显示，Pt VQ1、Pt VQ18和Pt VQ31对200 mmol·L-1 Na Cl处理均有响应。