《表2 样品比对信息统计》

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《120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析》

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对测序所得数据进行质控，分析各样品的碱基组成和碱基质量，结果显示每个测序样品的碱基组成中，A与T的曲线基本重合，G与C的曲线也基本重合，说明测序样品的碱基组成是平衡的。每个样品测序所得Reads碱基的质量分数基本都在Q20（碱基正确识别率为99%）以上。这些充分表明测序结果可靠，测序所得数据可以进行下一步分析。过滤低质量值数据后，WC-D120-B-1和WC-D120-B-3样品分别获得20 566 818条和21 126 204条reads；将各样品过滤后的数据与所选参考基因组的序列进行比对，比对率均大于60%，高质量匹配都在40%以上，多个位点配对均小于2%。具体见表2。