《表2 分布于10条染色体上的50对SSR引物信息》

《表2 分布于10条染色体上的50对SSR引物信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记》


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注:在引物的名称中,“r”后面的数字表示染色体号,“-”后面的数字表示引物编号。如Chr1-1,表示的是第一条染色体上的1号引物

为了检测开发SSR标记的有效性,本研究在位于编码区约800个SSR标记引物中,在每条染色体上挑选了5对相对均一覆盖整条染色体的SSR标记,在10条染色体上进行了引物的挑选、合成,共计50对引物,引物相关信息如表2所示。为了检验引物的实用性,利用了参考基因组高粱材料BTX623和杂交种辽糯3号,因为本研究在育种实践中很多时候利用的是杂交种材料。在50对引物中,两个材料中仅有一对引物未扩增出产物(Chr6-3两个亲本间无扩增),引物成功率高达98%,另有两对引物仅能在一个材料中进行扩增;另一个材料显示无扩增产物(Chr2-3,Chr2-5都是在BTX623中无扩增,在辽糯3中能正常扩增),最终显示有18对引物在这两个亲本间存在多态性。