《表2 12对SSR引物信息》

《表2 12对SSR引物信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《利用荧光标记SSR鉴别21个茶花新品种》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录
F:正向引物;R:反向引物F:Forward primer;R:Reverse primer

SSR引物的获得方式有2种,3对从前人的研究中获得(Kaundun and Matusmoto,2002;Freeman,2004;刘振等,2008);9对从本实验室所用的杜鹃红山茶(Camellia azalea Wei)的转录组数据中开发获得(表2)。从每个杂交组合中各挑取1个杂交新品种进行引物筛选实验。初步挑选出60对引物,由上海桑尼生物科技有限公司合成;并用1%的琼脂糖凝胶电泳和8%的聚丙烯酰氨凝胶电泳进行筛选。PCR反应体系10μL,包括6.15μL 3dH2O、1.0μL 10×PCR Buffer(Mg2+free)、0.8μL Mg2+(25 mmol·L–1)、0.6μL dNTP(2.5 mmol·L–1)、正向和反向引物各0.4μL、0.15μL Taq酶(5 U·μL–1)和0.5μL DNA模板。PCR反应程序为:94°C预变性3分钟;94°C变性30秒,各引物退火温度退火30秒,72°C延伸1分钟,30个循环;72°C延伸10分钟,4°C保存。先用1%的琼脂糖凝胶电泳检测各引物的扩增效率,然后用8%的聚丙烯酰氨凝胶电泳检测PCR产物多态性。各引物对扩增产物的上样量为1.5μL,分子量标准为50 bp DNA Ladder,180 V电压下电泳2小时,0.1%AgNO3染色15分钟,NaOH显色,拍照保存以备分析。将挑出的60对引物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选,获得12对条带清晰、多态性和稳定性高的引物,用于后续荧光毛细管电泳(表2)。