《表4 Small Indels的CDS区统计》

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《韩国赤芝全基因组重测序分析》

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根据样品的Clean Reads在参考基因组上的定位结果，检测韩芝与参考基因组间在CDS区的Small InDel变异，其变异总数为9 458个（表4）。根据检测得到的Small InDel位点在参考基因组上的位置信息，对比参考基因组的基因、CDS位置等信息，对InDel位点进行功能或类型的分类，结果（表5）所示。从表中可以看出，InDel变异多发生在基因的上游（37.31%）、下游（33.43%）区域和CDS区域（12.71%），在CDS区中，发生的变异大多为移码突变（50.58%）。