《表3 SNV/Indels在基因组不同功能区域的分布状况》
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《恶臭假单胞菌的正丁醇耐受性驯化及比较基因组学分析》
此外,根据物种的已知基因,将物种的基因组划分为不同的功能单位,然后依据突变所发生的位置,将每个突变位点进行功能区域分类,并对各样本所检测到的突变位点依据功能区进行分类统计。从表3发现,大部分突变位点分布在基因的外显子区,即CDS区或者m RNA区,而在nc RNA区、3'UTR区及一些剪切位点区域的突变个数是0,这说明突变发生在基因编码区中比较多,在非编码区突变很少,一方面可能是因为这些区域在基因组上所占比例较小,发生突变的概率较小;另一方面可能是因为突变发生在这些区域会影响到不同RNA之间的结合,因为突变位点若位于m RNA 3′UTR区,会影响micro RNA对其结合,导致m RNA降解受阻,m RNA表达会上升,进而影响到一些关键蛋白的表达,如与耐受性相关的外排泵蛋白及其他的膜蛋白。
图表编号 | XD00197634500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.01 |
作者 | 肖琳、吴安宁、许国超、韩瑞枝、倪晔 |
绘制单位 | 江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院 |
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