《表1 TCGA中7种肿瘤数据相关信息统计及分析结果概览》
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《基于TCGA数据预测肿瘤代表性新抗原的一种生物信息学新方案》
根据2018年中国癌症中心发布的2014年中国不同地区恶性肿瘤发病和死亡分析报告[20],以及2018年美国癌症协会发布的2014年美国癌症发病率、死亡率和存活率的数据[21],选取以下7种发病率或复发率较高的癌症作为研究对象,包括膀胱癌、乳腺癌、结肠癌、肝癌、胃癌及肺癌,其中肺癌的数据进一步划分为肺鳞状细胞癌与肺腺癌两类。测序数据均来源于TCGA中基因组测序数据,突变基因对应的氨基酸序列来自SwissPort数据库(https://www.uniprot.org/,序列下载日期为2018年11月)[22]。基因组参考序列为hg19,测序平台为IlluminaGA或IlluminaHiSeq。基因突变数据信息如表1所示。更多信息见补充附件1(可在网络版中下载)。
图表编号 | XD0074160800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 黄传玺、马洁、吴琛、朱云平 |
绘制单位 | 河北大学生命科学学院、蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心、军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心、河北大学生命科学学院、军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心 |
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