《表1 TCGA中7种肿瘤数据相关信息统计及分析结果概览》

《表1 TCGA中7种肿瘤数据相关信息统计及分析结果概览》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于TCGA数据预测肿瘤代表性新抗原的一种生物信息学新方案》


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根据2018年中国癌症中心发布的2014年中国不同地区恶性肿瘤发病和死亡分析报告[20],以及2018年美国癌症协会发布的2014年美国癌症发病率、死亡率和存活率的数据[21],选取以下7种发病率或复发率较高的癌症作为研究对象,包括膀胱癌、乳腺癌、结肠癌、肝癌、胃癌及肺癌,其中肺癌的数据进一步划分为肺鳞状细胞癌与肺腺癌两类。测序数据均来源于TCGA中基因组测序数据,突变基因对应的氨基酸序列来自SwissPort数据库(https://www.uniprot.org/,序列下载日期为2018年11月)[22]。基因组参考序列为hg19,测序平台为IlluminaGA或IlluminaHiSeq。基因突变数据信息如表1所示。更多信息见补充附件1(可在网络版中下载)。