《表1 原始特征值:基于SVM的蛋白质亚细胞定位预测》
传统的特征表达模型以氨基酸组成方法为主,这种构建方法只考虑了蛋白质序列的组成信息,但是实际中,蛋白质是一种折叠结构,它的残基之间会相互影响、相互作用。采用自相关系数方法构建特征表达模型可以把蛋白质序列中氨基酸的位置信息和不同距离氨基酸间的相互作用包含进去,蛋白质的结构信息能够更好地反映出来。为了更好地表示氨基酸相互作用对蛋白质亚细胞定位的影响,本文选用了氨基酸的6种特征(疏水性、亲水性、侧链分子量、极性、极化率、溶剂化自由能)来表达蛋白质序列[13]。其原始数值如表1所示。
图表编号 | XD0067427100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.01 |
作者 | 刘清华、赖裕平、丁洪伟、杨志军、崔晓龙 |
绘制单位 | 云南大学信息学院、北方工业大学计算机学院、云南大学信息学院、云南大学信息学院、云南大学微生物研究所 |
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