《表1 Cm ADF7蛋白亚细胞定位预测》

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《甜瓜ADF7基因的克隆与生物信息学分析》


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通过Prot Param预测蛋白质理化性质:Cm ADF7基因编码的137个氨基酸,理论分子量15.82102 k D,等电点5.32,蛋白原子组成C707H1097N185O213S7。在Cm ADF7蛋白的氨基酸组成中,有23个是负电荷氨基酸(Asp+Glu),21个是正电荷氨基酸(Arg+Lys)。该蛋白中富含丙氨酸(A)10.2%,谷氨酸(E)8.8%,天冬氨酸(D)8.0%,赖氨酸(K)9.5%,苯丙氨酸(F)8.8%。进一步分析氨基酸序列亲水性发现,85位的苯丙氨酸亲水性最强(1.111),而107位的精氨酸疏水性最强(-2.511),整个蛋白的氨基酸序列疏水性氨基酸多于亲水性氨基酸(图6)。说明Cm ADF7蛋白是疏水性蛋白。蛋白信号肽预测显示Cm ADF7蛋白不具有典型的信号肽。亚细胞定位发现Cm ADF7蛋白主要定位在细胞质中(表1)。