《表1 17-mer分析数据统计》

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《甘薯属耐盐植物马鞍藤基因组大小及特征分析》

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将马鞍藤21.71 Gb的数据用于17-mer分析频率分布。由图2可知，只有一个主峰值的出现，K-mer期望深度出现在21附近。由表1显示，K-mer总数为22081066699，通过公式（基因组大小=K-mer的总数/K-mer期望深度）计算出基因组的大小为1051.48 Mbp，排除错误K-mer带来的误差影响经修正后为1041.65 Mbp。根据图2，K-mer曲线拖尾现象较为明显，可能是马鞍藤基因组重复序列含量较高所导致。由1.3.3公式计算可得出，杂合率为0.99%。通过计算标准泊松分布和实际数据曲线峰值后的面积差值，可得到重复序列百分比。本研究中根据纯合峰深度后1.8倍的K-mer总数占所有K-mer数的百分比计算可得重复率为74.52%。