《表1 GhNHX7基因鉴定及特征》

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《陆地棉Gh NHX7基因特征及表达的生物信息学分析》


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通过同源性检索,在陆地棉基因组中鉴定出与拟南芥AtNHX7/SOS1相似性最高的2个基因Gh_A03G0996(相似度63%),Gh_D02G1385(相似度63%),分别命名为GhNHX7a和Gh NHX7b(表1)。GhNHX7a和Gh NHX7b分别位于A03和D02的染色体的中部区域。通过MCScanX分析发现,GhNHX7a和GhNHX7b基因随着全基因组/片段复制事件的发生而扩增。GhNHX7a和Gh NHX7b分别包含22个和21个外显子,与AtNHX7/SOS1外显子数目相近。GhNHX7a和GhNHX7b基因的编码区序列长度分别为3 549 bp和3 555 bp,GC含量均为41%。GhNHX7a和GhNHX7b分别编码包含1 182和1 184个氨基酸残基的蛋白质,分子量分别为131.437 kD和132.242 kD。