《表3 天然群体山核桃基因组DNA甲基化相对水平》

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《山核桃甲基化敏感扩增多态体系的建立与甲基化初步分析》

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由于MSAP技术中所用的2种同裂酶HpaⅡ和MspⅠ均不能有效地识别非5′-CCGG位点的胞嘧啶甲基化和内外侧胞嘧啶都甲基化的5′-CCGG位点[19]，且（0，0）位点在实验上是没有扩增产物的位点，也不排除位点缺失所致[29]，因此MSAP检测到的甲基化位点数比实际的偏低。定义半甲基化类型与内侧胞嘧啶甲基化类型位点数之和为总甲基化位点数，并将一个村的样品视作来自一个居群。基于MSAP分析结果可以看出:山核桃甲基化相对水平变异系数在20%左右，总甲基化相对水平和非甲基化相对水平分别为25.99%±2.42%和33.38%±3.66%，非甲基化相对水平大于总甲基化相对水平，且两者间差异极显著（P<0.001）；总甲基化中半甲基化相对水平和内侧胞嘧啶甲基化相对水平分别为7.89%±1.53%和18.10%±3.94%，内侧胞嘧啶甲基化相对水平远大于半甲基化相对水平，且两者间差异极显著（P<0.001）（表3） 。对3个居群山核桃之间的甲基化状态进行比较，其中林竹村总甲基化相对水平（28.00%）和内部胞嘧啶甲基化相对水平（21.33%）最高，而其半甲基化相对水平（6.66%）和非甲基化相对水平（29.16%）最低；潘张村的半甲基化相对水平（9.60%）和非甲基化水平（35.61%）最高，其总甲基化相对水平（23.31%）和内侧胞嘧啶甲基化相对水平（13.71%）最低；指南村各项相对水平居中。此研究中山核桃总甲基化相对水平和内侧胞嘧啶甲基化相对水平高，则半甲基化相对水平和非甲基化相对水平则相对较低，反之亦然（表3）。