《表2 红芽芋超低温疗法脱毒苗基因组DNA甲基化水平分析》
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《红芽芋超低温疗法脱毒苗基因组DNA甲基化的MSAP分析》
注:总甲基化率=[(Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%;全甲基化率=[(Ⅲ+Ⅳ)]/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%;半甲基化率=[Ⅱ/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%。Note:Total methylation rate=[(Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×100%;full-methylation rate=[(Ⅲ+Ⅳ)]/(Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)]×1
依据HpaⅡ和MspⅠ对甲基化敏感程度不同,MSAP片段可分为4种类型:第Ⅰ类型EcoRⅠ/HpaⅡ和EcoRⅠ/MspⅠ中均有条带,甲基化的位点无改变;第Ⅱ类型EcoRⅠ/HpaⅡ有条带而EcoRⅠ/MspⅠ中无条带(仅有1条链甲基化的半甲基化位点);第Ⅲ类型EcoRⅠ/HpaⅡ无条带(两条链均甲基化)而EcoRⅠ/MspⅠ中有条带;第Ⅳ类型EcoRⅠ/HpaⅡ和EcoRⅠ/MspⅠ中均无条带[12]。本试验采用10对选择性扩增引物组合(E32MSP40、E32MSP48、E35MSP48、E36MSP43、E37MSP48、E39MSP44、E40MSP44、E50MSP43、E78MSP40、E86MSP48)对双酶切后的30个样本进行扩增(图2)。红芽芋超低温疗法脱毒苗基因组DNA甲基化水平分析见表2。从表2可知,对照组总扩增带数522条,甲基化总带数297条,总甲基化率57.06%,全甲基化带数194条,全甲基化率37.22%,半甲基化带数103条,半甲基化率19.84%;处理组总扩增带数504条,甲基化总带数339条,总甲基化率67.33%,全甲基化带数253条,全甲基化率50.2%,半甲基化带数86条,半甲基化率17.13%。表明超低温疗法脱毒后,总甲基化率提高10.27%,全甲基化率提高12.98%,但半甲基化率下降2.71%。
图表编号 | XD0043987900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.25 |
作者 | 尹明华、廖玉、万志庭 |
绘制单位 | 上饶师范学院生命科学学院、上饶师范学院生命科学学院、上饶师范学院生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |