《表2 多序列比对Yarn集群节点数增加的实验结果》

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《基于Yarn云平台的生物基因多序列比对并行算法》

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在PW阶段共有49个子任务，每个子任务需要完成25次双序列比对，PW阶段需进行总共49×25=1 225次双序列比对，前面提到每个子任务在同等硬件配置的PC机上运行时间约为35 min，则如果串行计算PW阶段整体的时间应该为35×49=1 715 min。通过Yarn＿ClustalW并行计算，随着物理节点个数的不同，PW阶段具体完成时间（表2），表明33节点情况下，整个程序在半个工作日可以完成（238 Mins），是科研工作者可以接受的时间范围，Yarn＿ClustalW方法的运行时间随着云平台中物理节点个数的增加而缓慢增加，符合我们预想的结果，其计算时间均小于同等条件下的MapReduce计算，这也是Yarn性能优于MapReduce的原因。