《表6 另外11个哺乳动物Tas2R3基因序列信息》

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《羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析》

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采用Chromosoma1.62，Seq Man，Edit Seq，Megalign等序列比对软件对所测的Tas2R3基因序列进行人工校对、编辑，确保序列的正确无误。利用NCBI网站的Blast和OFR Finder在线软件（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorffgorf.htm1）分别对羚牛Tas2R3基因序列进行同源性搜索比对和开放阅读框（OFR）的预测。羚牛Tas2R3基因蛋白的亲疏水性等理化性质的预测在ExPASy在线软件（http://au.expasy.org）中进行。利用CBS Prediction（http://www.cbs.dtu.dk/services/）中的NetPhos3.1和NetGlycate1.0在线工具对磷酸化和糖基化功能位点进行预测分析。利用在线分析软件HNN secondarystructure prediction method（https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa＿automat.pl?page=/NPSA/npsa＿hnn.html）对Tas2R3基因蛋白的二级结构进行预测。Tas2R3基因蛋白的功能结构域利用SMART（http://smart.embl-heidelberg.de/）在线分析软件进行预测，跨膜结构利用TMHMM在（http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM）线软件进行预测。利用MEGA 6.0软件对羚牛Tas2R3基因的序列特征、碱基组成、氨基酸组成、突变位点、简约信息位点等进行统计分析。从GenBank和Ensembl中下载另外11种哺乳动物的Tas2R3基因CDS序列进行数据分析（表6），运用Kimura双参数模型构建NJ（Neighbor-Joining）和ME（Minimum evolution）系统进化树。