《表2 白木香3代共有的差异表达转录因子》

《表2 白木香3代共有的差异表达转录因子》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《盐胁迫下的3代白木香离体根的转录因子表达分析》


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3代共有的差异表达转录因子数有70个(图5),分布于22个TFs家族,以ERF、bHLH、B3和MYB(9、8、6、6)4个家族富集数量最多(表2)。70个3代共有差异表达TFs的相对表达量同样以下调为主,在第1代下调表达的基因有50个,第2代下调表达的基因有41个,第3代下调表达的基因有48个;在3代中全部表现出上调表达的基因仅12个,其中WOX家族的基因在3代中均表现为上调表达(表2)。在第1代上调表达log2FC值最高的6个基因在3代中全部表现出上调表达[Unigene0020933(b HLH)、Unigene0015987(C2H2)、Unigene0016607(B3)、Unigene0031459(WOX)、Unigene0040676(ERF)、Unigene0031455(WOX)]。其中Unigene0040676(ERF)上调表达log2FC值第1、2代相近,第3代为第1、2代的4倍,被预测为ERF062-like乙烯响应转录因子。70个基因中被预测为乙烯响应转录因子的共有9个基因,其中8个隶属于ERF家族,1个属于AP2家族。仅在第1代下调表达,第2、3代上调表达的基因有6个[Unigene0038094(ERF)、Unigene0011437(AP2)、Unigene0028105(DBB)、Unigene0020062(WRKY)、Unigene0005341(ERF)、Unigene0020064(WRKY)]。在3代持续下调表达的基因中,Unigene0044600(C2H2)、Unigene0016964(NAC)、Unigene0002712(EIL)、Unigene0036765(ZF-HD)、Unigene0016718(bZIP)、Unigene0010888(MYB)、Unigene0019323(NF-YA)和Unigene0004126(ERF)的下调表达倍数随代数增加而递增,其中Unigene0044600(C2H2)第3代的差异表达倍数是第1代的5倍。