《表2 白木香3代共有的差异表达转录因子》
3代共有的差异表达转录因子数有70个(图5),分布于22个TFs家族,以ERF、bHLH、B3和MYB(9、8、6、6)4个家族富集数量最多(表2)。70个3代共有差异表达TFs的相对表达量同样以下调为主,在第1代下调表达的基因有50个,第2代下调表达的基因有41个,第3代下调表达的基因有48个;在3代中全部表现出上调表达的基因仅12个,其中WOX家族的基因在3代中均表现为上调表达(表2)。在第1代上调表达log2FC值最高的6个基因在3代中全部表现出上调表达[Unigene0020933(b HLH)、Unigene0015987(C2H2)、Unigene0016607(B3)、Unigene0031459(WOX)、Unigene0040676(ERF)、Unigene0031455(WOX)]。其中Unigene0040676(ERF)上调表达log2FC值第1、2代相近,第3代为第1、2代的4倍,被预测为ERF062-like乙烯响应转录因子。70个基因中被预测为乙烯响应转录因子的共有9个基因,其中8个隶属于ERF家族,1个属于AP2家族。仅在第1代下调表达,第2、3代上调表达的基因有6个[Unigene0038094(ERF)、Unigene0011437(AP2)、Unigene0028105(DBB)、Unigene0020062(WRKY)、Unigene0005341(ERF)、Unigene0020064(WRKY)]。在3代持续下调表达的基因中,Unigene0044600(C2H2)、Unigene0016964(NAC)、Unigene0002712(EIL)、Unigene0036765(ZF-HD)、Unigene0016718(bZIP)、Unigene0010888(MYB)、Unigene0019323(NF-YA)和Unigene0004126(ERF)的下调表达倍数随代数增加而递增,其中Unigene0044600(C2H2)第3代的差异表达倍数是第1代的5倍。
图表编号 | XD0061812500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.28 |
作者 | 方泽蘅、李文月、马新业、詹若挺 |
绘制单位 | 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室、广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室、广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室、广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室 |
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